ThS.BS.CKI Nguyễn Trung Nguyên tốt nghiệp trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch, sau đó được đào tạo theo chương trình bác sĩ nội trú của trường Đại học Y dược TP HCM tại các bệnh viện lớn như Bệnh viện Tai Mũi Họng TP HCM, Bệnh viện Chợ Rẫy, Bệnh viện Đại học Y dược TP HCM, Bệnh viện Nhi Đồng 1, Bệnh viện Gia Định.
2011 - 2017: Bác sĩ Đa khoa, Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch TP HCM
2017 - 2018: Bác sĩ Nội trú, Bệnh viện Tai Mũi Họng TP HCM, Bệnh viện Chợ Rẫy
2018 - 2019: Bác sĩ Nội trú, Bệnh viện Đại học Y dược TP HCM, Bệnh viện Nhân dân Gia Định, Bệnh viện Nhi Đồng 1
2018: Hoàn thành lớp Nội soi chẩn đoán bệnh lý Tai Mũi Họng, Đại học Y dược TP HCM
2019: Hoàn thành lớp Kỹ thuật thính học cơ bản tại trường Đại học Y dược TP HCM
2019 – 2020: Làm đề tài nghiên cứu khoa học tại Bệnh viện Đại học Y Dược TP HCM và bộ môn giải phẫu trường Đại học Y Dược TP HCM
2019 – nay: Tham gia các buổi cập nhật kiến thức và đào tạo liên tục trong và ngoài nước như của Hội Tai Mũi Họng Việt Nam, Hội Tai Mũi Họng TP HCM và các tỉnh phía Nam, Hiệp hội Tai Mũi Họng Châu Á – Thái Bình Dương (APOST), Hiệp hội Tai Mũi Họng Hoa Kỳ (AAO-HNSF).
01/2021 - 01/2022: Bệnh viện Đại học Y dược TP HCM
02/2022 - nay: Bệnh viện Đa khoa Tâm Anh TP HCM